ЕВОЛЮЦІЯ ВАРІАНТІВ SARS-COV-2: ГЛОБАЛЬНІ ЗАКОНОМІРНОСТІ, НОВІ СУБВАРІАНТИ ТА РЕГІОНАЛЬНИЙ КОНТЕКСТ (УКРАЇНА ТА ВІЛ)
DOI:
https://doi.org/10.11603/1681-2727.2026.1.16166Ключові слова:
SARS-CoV-2, варіанти, що викликають занепокоєння, Omicron, JN.1, BA.2.86, рекомбінація, уникнення імунної відповіді, геномний нагляд, Україна, ВІЛ, імунокомпрометовані пацієнти, антиретровірусна терапіяАнотація
РЕЗЮМЕ. З кінця 2019 р. SARS-CoV-2 еволюціонував у велику кількість ліній, що зумовило повторювані хвилі COVID-19 у світі. У цьому огляді узагальнені сучасні відомості про еволюційну динаміку SARS-CoV-2 з особливим акцентом на субваріантах Omicron, зокрема JN.1 та його похідні, а також на нових лініях, що з’являються у 2025 р. (Nimbus і Stratus).
Окреслено ключові механізми, які зумовлюють різноманіття вірусу, – мутації та антигенний дрейф, рекомбінацію, а також тривалу персистенцію збудника в імунокомпрометованих осіб (у тому числі людей, які живуть з ВІЛ). Саме ці процеси можуть сприяти поетапному накопиченню мутацій, що забезпечують вислизання від імунної відповіді.
Огляд охоплює наукові публікації та звіти з геномного нагляду за 2019–2025 рр. (ресурси ВООЗ, GISAID, outbreak.info, PubMed/Scopus) і зосереджується на мутаційних профілях ключових варіантів, глобальних тенденціях їх поширення і специфічному для України контексті.
Окремий розділ присвячено аналізу причин, чому Україна, попри відносно значний тягар ВІЛ у Східній Європі, не розглядається як значуще джерело глобально домінантних варіантів, що викликають занепокоєння. Серед можливих пояснень обговорюються обмежене секвенування, нижчий потенціал міжнародного поширення, розширення доступу до антиретровірусної терапії, а також випадкові й структурні чинники, необхідні для масового розповсюдження нових вірусних ліній.
У підсумку приходимо до висновку, що подальше уникнення імунної відповіді залишається ймовірним, що підкреслює потребу в ефективному геномному нагляді, своєчасному оновленні вакцин і терапевтичних підходів, а також в інтеграції моніторингу COVID-19 із програмами допомоги людям, які живуть з ВІЛ.
Посилання
World Health Organization. (2023–2025). Tracking SARS-CoV-2 variants. World Health Organization. https://www.who.int
Rambaut, A., Holmes, E. C., O’Toole, Á., Hill, V., McCrone, J. T., Ruis, C., du Plessis, L., & Pybus, O. G. (2020). A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology, 5(11), 1403–1407. https://doi.org/10.1038/s41564-020-0770-5 DOI: https://doi.org/10.1038/s41564-020-0770-5
Harvey, W. T., Carabelli, A. M., Jackson, B., Gupta, R. K., Thomson, E. C., Harrison, E. M., Ludden, C., Reeve, R., Rambaut, A., Peacock, S. J., & Robertson, D. L. (2021). SARS-CoV-2 variants, spike mutations and immune escape. Nature Reviews Microbiology, 19(7), 409–424. https://doi.org/10.1038/s41579-021-00573-0 DOI: https://doi.org/10.1038/s41579-021-00573-0
Viana, R., Moyo, S., Amoako, D. G., Tegally, H., Scheepers, C., Althaus, C. L., … de Oliveira, T. (2022). Rapid epidemic expansion of the SARS-CoV-2 Omicron variant in southern Africa. Nature, 603(7902), 679–686. https://doi.org/10.1038/s41586-022-04411-y DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-022-04411-y
Cele, S., Jackson, L., Khoury, D. S., Khan, K., Moyo-Gwete, T., Tegally, H., … Sigal, A. (2022). Omicron extensively but incompletely escapes Pfizer BNT162b2 neutralization. Nature, 602(7898), 654–656. https://doi.org/10.1038/s41586-021-04387-1 DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-021-04387-1
Planas, D., Saunders, N., Maes, P., Guivel-Benhassine, F., Planchais, C., Buchrieser, J., … Schwartz, O. (2022). Considerable escape of SARS-CoV-2 Omicron to antibody neutralization. Nature, 602(7898), 671–675. https://doi.org/10.1038/s41586-021-04389-z DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-021-04389-z
Cao, Y., Yisimayi, A., Jian, F., Song, W., Xiao, T., Wang, L., … Xie, X. S. (2022). BA.2.12.1, BA.4 and BA.5 escape antibodies elicited by Omicron infection. Nature, 608(7923), 593–602. https://doi.org/10.1038/s41586-022-04980-y DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-022-04980-y
Santos da Silva, E., Servais, J. Y., Kohnen, M., Arendt, V., Gilson, G., Staub, T., Seguin-Devaux, C., & Perez-Bercoff, D. (2023). Vaccine- and breakthrough infection-elicited pre-Omicron immunity more effectively neutralizes Omicron BA.1, BA.2, BA.4 and BA.5 than pre-Omicron infection alone. Current Issues in Molecular Biology, 45(2), 1741–1761. https://doi.org/10.3390/cimb45020112 DOI: https://doi.org/10.3390/cimb45020112
Tamura, T., Ito, J., Uriu, K., Zahradnik, J., Kida, I., Anraku, Y., … Sato, K. (2023). Virological characteristics of the SARS-CoV-2 XBB variant derived from recombination of two Omicron subvariants. Nature Communications, 14, Article 2800. https://doi.org/10.1038/s41467-023-38435-3 DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-023-38435-3
Tamura, T., Mizuma, K., Nasser, H., Deguchi, S., Padilla-Blanco, M., Oda, Y., … Sato, K. (2024). Virological characteristics of the SARS-CoV-2 BA.2.86 variant. Cell Host & Microbe, 32(2), 170–180.e12. https://doi.org/10.1016/j.chom.2024.01.001 DOI: https://doi.org/10.1016/j.chom.2024.01.001
Khare, S., Gurry, C., Freitas, L., Schultz, M. B., Bach, G., Diallo, A., Akite, N., Ho, J., Lee, R. T., Yeo, W., GISAID Curation Team, & Maurer-Stroh, S. (2021). GISAID’s role in pandemic response. China CDC Weekly, 3(49), 1049–1051. https://doi.org/10.46234/ccdcw2021.255 DOI: https://doi.org/10.46234/ccdcw2021.255
European Centre for Disease Prevention and Control. (2025). SARS-CoV-2 variants situation updates. European Centre for Disease Prevention and Control. https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
Tarcsai, K. R., Corolciuc, O., Tordai, A., & Ongrádi, J. (2022). SARS-CoV-2 infection in HIV-infected patients: Potential role in the high mutational load of the Omicron variant emerging in South Africa. GeroScience, 44(5), 2337–2345. https://doi.org/10.1007/s11357-022-00603-6 DOI: https://doi.org/10.1007/s11357-022-00603-6
Kandeel, M., Mohamed, M. E. M., El-Lateef, H. M. A., Verugopala, K. N., & El-Beltagi, H. S. (2022). Omicron variant genome evolution and phylogenetics. Journal of Medical Virology, 94, 1627–1632. https://doi.org/10.1002/jmv.27515 DOI: https://doi.org/10.1002/jmv.27515
Magiorkinis, G. (2023). On the evolution of SARS-CoV-2 and the emergence of variants of concern. Trends in Microbiology, 31(1), 5–8. https://doi.org/10.1016/j.tim.2022.10.008 DOI: https://doi.org/10.1016/j.tim.2022.10.008
European Centre for Disease Prevention and Control. (2022). Assessment of the further spread and potential impact of the SARS-CoV-2 Omicron variant of concern in the EU/EEA (19th update, 27 January 2022). European Centre for Disease Prevention and Control. DOI: https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2022.27.43.2210271
Thye, A. Y., Law, J. W., Pusparajah, P., Letchumanan, V., Chan, K.-G., & Lee, L.-H. (2021). Emerging SARS-CoV-2 variants of concern (VOCs): An impending global crisis. Biomedicines, 9(10), Article 1303. https://doi.org/10.3390/biomedicines9101303 DOI: https://doi.org/10.3390/biomedicines9101303
World Health Organization. (n.d.). WHO COVID-19 variants dashboard. World Health Organization. https://data.who.int/dashboards/covid19/variants
Dimaano, A., Carreon, K. D., Camaya, G. S., Rondolo, I., & Tolentino, J. E. (2024). Genomic analysis of the SARS-CoV-2 variants circulated in the Philippines, 2020–2024. Dialogues in Health, 5, Article 100193. https://doi.org/10.1016/j.dialog.2024.100193 DOI: https://doi.org/10.1016/j.dialog.2024.100193
Gangavarapu, K., Latif, A. A., Mullen, J. L., Alkuzweny, M., Hufbauer, E., Tsueng, G., … Hughes, L. D. (2023). Outbreak.info genomic reports: Scalable and dynamic surveillance of SARS-CoV-2 variants and mutations. Nature Methods, 20(4), 512–522. https://doi.org/10.1038/s41592-023-01769-3 DOI: https://doi.org/10.1038/s41592-023-01769-3
Joint United Nations Programme on HIV/AIDS. (2024). Global AIDS update: Eastern Europe and Central Asia (EECA) profile. UNAIDS.
Choi, B., Choudhary, M. C., Regan, J., Sparks, J. A., Padera, R. F., Qiu, X., Solomon, I. H., Kuo, H.-H., Boucau, J., Bowman, K., Adhikari, U. D., Winkler, M. L., Mueller, A. A., Hsu, T. Y., Desjardins, M., Baden, L. R., Chan, B. T., Walker, B. D., Lichterfeld, M., … Li, J. Z. (2020). Persistence and evolution of SARS-CoV-2 in an immunocompromised host. New England Journal of Medicine, 383(23), 2291–2293. https://doi.org/10.1056/NEJMc2031364 DOI: https://doi.org/10.1056/NEJMc2031364
Clark, S. A., Clark, L. E., Pan, J., Coscia, A., McKay, L. G. A., Shankar, S., Johnson, R. I., Brusic, V., Choudhary, M. C., Regan, J., Li, J. Z., Griffiths, A., & Abraham, J. (2021). SARS-CoV-2 evolution in an immunocompromised host reveals shared neutralization escape mechanisms. Cell, 184(10), 2605–2617.e18. https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.03.027 DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.03.027
Iaruchyk, A., Farlow, J., Skrypnyk, A., Matchyshyn, S., Kovalchuk, A., Demchyshyna, I., Rosada, M., Aregay, A. K., & Habicht, J. (2025). Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Ukraine from May 2022 to March 2024 reveals Omicron variant dynamics. Viruses, 17(7), Article 1000. https://doi.org/10.3390/v17071000 DOI: https://doi.org/10.3390/v17071000
Centers for Disease Control and Prevention. (n.d.). Variant proportions and genomic surveillance. CDC. https://www.cdc.gov/covid/php/variants/variants-and-genomic-surveillance.html
Neduzhko, O., Kiriazova, T., Zeziulin, O., Legkostup, L., Riabokon, S., DeHovitz, J. A., & Dumchev, K. (2024). The effects of the COVID-19 pandemic on HIV service provision in Ukraine. Journal of the International Association of Providers of AIDS Care, 23, 23259582241277649. https://doi.org/10.1177/23259582241277649 DOI: https://doi.org/10.1177/23259582241277649
Parczewski, M., & Gökengin, D. (2024). The HIV epidemic in Eastern Europe and Central Asia in difficult times: A story of resilience and change. Journal of the International AIDS Society, 27(Suppl 3), e26325. https://doi.org/10.1002/jia2.26325 DOI: https://doi.org/10.1002/jia2.26325
Weigang, S., Fuchs, J., Zimmer, G., Schnepf, D., Kern, L., Beer, J., Luxenburger, H., Ankerhold, J., Falcone, V., Kemming, J., Hofmann, M., Thimme, R., Neumann-Haefelin, C., Ulferts, S., Grosse, R., Hornuss, D., Tanriver, Y., Rieg, S., Wagner, D., … Kochs, G. (2021). Within-host evolution of SARS-CoV-2 in an immunosuppressed COVID-19 patient as a source of immune escape variants. Nature Communications, 12, Article 6405. https://doi.org/10.1038/s41467-021-26602-3 DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-26602-3
Rocklöv, J., & Sjödin, H. (2020). High population densities catalyze the spread of COVID-19. Journal of Travel Medicine, 27(3), taaa038. https://doi.org/10.1093/jtm/taaa038 DOI: https://doi.org/10.1093/jtm/taaa038
##submission.downloads##
Опубліковано
Як цитувати
Номер
Розділ
Ліцензія
Авторське право (c) 2026 L. R. Shostakovych-Koretska
Ця робота ліцензується відповідно до Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.
Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:
- Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи, яка через [ВКАЖІТЬ ПЕРІОД ЧАСУ] з дати публікації автоматично стає доступною на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
- Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).
##plugins.generic.dates.accepted## 2026-04-18
##plugins.generic.dates.published## 2026-04-20
