ФОТОАКТИВНІСТЬ БІОЛОГІЧНИХ МОЛЕКУЛ ЯК МОЖЛИВИЙ ФАКТОР КОРЕГУВАННЯ ТРИГЕРЗАЛЕЖНИХ СИСТЕМНИХ ПРОЦЕСІВ (ПЕРШЕ ПОВІДОМЛЕННЯ)

O. P. Mintser; D. V. Vatlitsov

doi:10.11603/mie.1996-1960.2015.4.5436

Автор(и)

O. P. Mintser Національна медична академія післядипломної освіти імені П. Л. Шупика http://orcid.org/0000-0002-7224-4886
D. V. Vatlitsov Національна медична академія післядипломної освіти імені П. Л. Шупика http://orcid.org/0000-0001-8771-6623

DOI:

https://doi.org/10.11603/mie.1996-1960.2015.4.5436

Анотація

Застосування нового системного підходу до розгляду проблем регуляції та концептуального впливу на певні ланки
створює умови для накопичення та врахування всіх відомих результатів численних досліджень. Перегляд мішеней
електромагнітного опромінення УФ, видимого та ІЧ спектрів із застосуванням інструменттів системної біології визна-
чає механізми корекції внутрішньоклітинних системних процесів. Метою даної роботи було формування концепції
фотоактивації тригерних біомолекул живої клітини як фактора корегування внутрішньоклітинних системних процесів.
Застосовувався контент-аналіз, коллокейт аналіз та дані, отримані з бази відомих та передбачуваних взаємодій біо-
молекул. Було виокремлено чотири результуючі фотоактивації світлом видимого діапазону тригерзалежних системних процесів живої клітини: співрозмірність тригерів з довжиною хвилі; частотно-резонансна активація/деактивація; обумовлене поляризацією зростання енергії світлового потоку; асиметрична відповідь живих систем. Показано, що фізико-хімічні особливості біополімерів обумовлюють можливість проведення корекції тригерзалежних процесів, а асиметричність відповіді живих систем сумарно зі збільшенням надходження до системи енергії приводить до активації механізмів, направлених на виживання.

Посилання

Molecular cell biology / ed. H. F. Lodish. - New York : W. H. Freeman and Co, 2013.

Gunawardena J. Models in systems biology: the parameter problem and the meanings of robustness / J. Gunawardena // Elements of computational systems biology. - 2010. - Vol. 1.

Ghosh S. Software for systems biology: from tools to integrated platforms / S. Ghosh, Y. Matsuoka, Y. Asai[et al.] // Nature Reviews Genetics. - 2011.

Weaving knowledge into biological pathways in a collaborative manner / Y. Matsuoka, K. Fujita, S. Ghosh, H. Kitano // Computational Systems Toxicology / J. Hoeng, M. C. Peitsch. - New York, NY : Springer New York, 2015. - P. 181-208.

Asai Y. A versatile platform for multilevel modeling of physiological systems: sbml-phml hybrid modeling and simulation / Y. Asai, T. Abe, H. Oka[et al.] // Advanced Biomedical Engineering. - 2014. - Vol. 3, No. 0. - P. 5058.

Schmid F.-X. Biological macromolecules: uv-visible spectrophotometry / F.-X. Schmid // eLS. 2001.

Benz R. W. Diffraction-based density restraints for membrane and membrane-peptide molecular dynamics simulations / R. W. Benz, H. Nanda, F. Castro-Roman [et al.] // Biophysical Journal. - 2006. - Vol. 91, No. 10. -P. 3617-3629.

Arzensek D. Dynamic light scattering and application to proteins in solutions / D. Arzensek. - 2010. - P. 1-18.

Супрун А. Д. Теоретичні основи фізики функціонування білків / А. Д. Супрун // Київський національний ун-т імені Тараса Шевченка. - 2010.

Study of protein hydrodynamics with light scattering: size and charge of lysozyme / Y. Zhang, E. Farrell, D. Mankiewicz, Z. Weiner.

Мінцер О. П. Щодо межі доцільності використання поняття «тригерні взаємодії» у біології та медицині. перше повідомлення - постановка проблеми / О. П. Мінцер, К. М. Ігрунова // Медична інформатика та інженерія. -2014. - № 4. - P. 14-22.

Мінцер О. Онтологічна модель процесів програмованої клітинної загибелі / О. Мінцер, Д. Ватліцов // Медична інформатика та інженерія. - 2015. - № 2. - P. 14-26.

Methods for comparing data across differently designed agronomic studies: examples of different meta-analysis methods used to compare relative composition of plant foods grown using organic or conventional production methods and a protocol for a systematic review / K. Brandt, D. Srednicka-Tober, M. Baranski[et al.] // Journal of Agricultural and Food Chemistry. - 2013. - Vol. 61, № 30.- P. 7173-7180.

Writing@csu / [Електронний ресурс] http://writing. colostate.edu.

Mello R. A. Collocation analysis: a method for conceptualizing and understanding narrative data / R. A. Mello // Qualitative research. - 2002. - Vol. 2, № 2.- P. 231-243.

Panther - gene list analysis / [Електронний ресурс] http://pantherdb.org/ .

Uniprot / [Електронний ресурс] http://www.uniprot.org/.

Stitch: chemical association networks / 2015 [Електронний ресурс] http://stitch.embl.de/cgi/show_input_page.pl ?UserId=JVpPzrmqaBsj&sessionId=7Rj9WLk964bn.

Size comparisons among integral membrane transport protein homologues in bacteria, archaea, and eucarya / Y. J. Chung, C. Krueger, D. Metzgar, M. H. Saier // Journal of Bacteriology. - 2001. - Vol. 183, No. 3. - P. 1012-1021.

Proteopedia: a status report on the collaborative, 3d web-encyclopedia of proteins and other biomolecules / J. Pri-lusky, E. Hodis, D. Canner [et al.] // Journal of Structural Biology. - 2011. - Vol. 175, № 2. - P. 244-252.

Rcsb protein data bank - rcsb pdb /[Електронний ресурс] http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do.

Netrebko A. V. Subglobular oscillations of protein molecules in water overdamped? / A. V. Netrebko, Yu. M. Romanovsky, A. Yu. Chikishev // 2003. - Vol. 6, № 13. - P. 827-838.