МОЛЕКУЛЯРНІ МЕТОДИ ДІАГНОСТИКИ ГОСТРОГО БАКТЕРІАЛЬНОГО МЕНІНГІТУ НА ТРЕТИННОМУ РІВНІ НАДАННЯ МЕДИЧНОЇ ДОПОМОГИ У ЛІКАРНЯХ ПІВНІЧНОЇ ІНДІЇ
DOI:
https://doi.org/10.11603/ijmmr.2413-6077.2020.1.11103Ключові слова:
спинномозкова рідина (СМР), гострий бактеріальний менінгіт, ПЛР, MALDI-TOFАнотація
Вступ. Гострий бактеріальний менінгіт – одне з найбільш небезпечних інфекційних захворювань, що слугує додатковим тягарем для системи охорони здоров’я. Відповідне лікування – необхідна умова для попередження та лікування тяжких наслідків хвороби.
Мета дослідження – встановлення етіологічних чинників гострого бактеріального менінгіту за допомогою ПЛР.
Методи. Загалом було відібрано 276 зразків спинномозкової рідини (СМР) від пацієнтів з підозрою на бактеріальний менінгіт для визначення його основних збудників S. pneumoniae, H. influenzae, N. meningitidis, E. coli та стрептококів групи B типовим способом та за допомогою методів молекулярної діагностики. Для проведення культурального дослідження зразків СМР використовували живильні середовища: кров’яний агар, шоколадний агар, середовище МакКонкі. Зразки інкубували при 37°C протягом 24-48 годин. Ріст бактерій досліджували методом мас-спектрометрії з лазерною десорбцією/іонізацією MALDI-TOF. Мультиплексна ПЛР зразків СМР проводилася з використанням наборів для екстракції ДНК Qiagen (USA).
Результати. Із 276 досліджених зразків СМР, п’ять (1.87%) були культуро-позитивними (три – S. pneumoniae та два зразки – E. coli). За допомогою типової ПЛР ДНК збудника було знайдено у 28 зразках (10.49%). З цих 28 зразків у 20 (71.43%) – були ідентифіковані S. pneumoniae, а у 8 зразках (28.57%) – E. coli. Серед зразків, де було виявлено S. pneumoniae, 15 (53.57%) належали дітям до 5 років. E. coli переважала у новонароджених. Чутливість та специфічність ПЛР була 100% та 95-98% відповідно.
Висновки. Streptococcus pneumoniae – найбільш поширений збудник бактеріального менінгіту у дітей віком до 5 років. Враховуючи результати наших досліджень, ПЛР-діагностика повинна впроваджуватися у комплекс методів діагностики гострого бактеріального менінгіту.
Посилання
McIntyre PB, O’Brien KL, Greenwood B, Van de Beek D. Effect of vaccines on bacterial meningitis worldwide. Lancet. 2012; 380:1703–11.
doi: 10.1016/s0140-6736(12)61187-8 DOI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(12)61187-8
Kabra SK, Praveen Kumar, Verma IC, Mukherjee D, Chowdhary BH, Sengupta S, et al. Bacterial meningitis in India: An IJP survey. Indian J Pediatr. 1991;58:505-11.
doi: 10.1007/bf02750932 DOI: https://doi.org/10.1007/BF02750932
Tang LM, Chen ST, Hsu WC, Lyu RK. Acute bacterial meningitis in adults: A hospital-based epidemiological study. QJM. 1999;92:719-25.
doi: 10.1093/qjmed/92.12.719 DOI: https://doi.org/10.1093/qjmed/92.12.719
Ayaz C, Mehmet FG, Hosoglu S, Mustafa KC, Akalin S, Omer FK. Characteristics of acute bacterial meningitis in Southeast Turkey. Indian J Med Sci. 2004;58:327-33.
Chinchankar N, Mane M, Bhave S, Bapat S, Bavdekar A, Pandit A, Niphadkar KB, Dutta A, Leboulleux D. Diagnosis and outcome of acute bacterial meningitis in early childhood. Indian pediatrics. 2002 Oct 13;39(10):914-21.
Van de Beek D, de Gans J, Tunkel AR, Wijdicks EF. Community-acquired bacterial meningitis in adults. New England Journal of Medicine. 2006 Jan 5;354(1):44-53.
doi: 10.1056/nejmra052116 DOI: https://doi.org/10.1056/NEJMra052116
Schuchat A, Robinson K, Wenger JD, Harrison LH, Farley M, Reingold AL, Lefkowitz L, Perkins BA. Bacterial meningitis in the United States in 1995. New England journal of medicine. 1997 Oct 2;337(14): 970-6.
doi: 10.1056/nejm199710023371404 DOI: https://doi.org/10.1056/NEJM199710023371404
Kasanmoentalib ES, Brouwer MC, van de Beek D. Update on bacterial meningitis: epidemiology, trials and genetic association studies. Current opinion in neurology. 2013 Jun 1;26(3):282-8. DOI: https://doi.org/10.1097/WCO.0b013e328360415c
doi: 10.1097/wco.0b013e328360415c
Liu L, Oza S, Hogan D, Perin J, Rudan I, Lawn JE, Cousens S, Mathers C, Black RE. Global, regional, and national causes of child mortality in 2000–13, with projections to inform post-2015 priorities: an updated systematic analysis. The Lancet. 2015 Jan 31;385(9966):430-40.
doi: 10.1016/s0140-6736(14)61698-6 DOI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(14)61698-6
Brouwer MC, Tunkel AR, van de Beek D. Epidemiology, diagnosis, and antimicrobial treatment of acute bacterial meningitis. Clinical microbiology reviews. 2010 Jul 1;23(3):467-92.
doi: 10.1128/cmr.00070-09 DOI: https://doi.org/10.1128/CMR.00070-09
Greisen K, Loeffelholz M, Purohit A, Leong D. PCR primers and probes for the 16S rRNA gene of most species of pathogenic bacteria, including bacteria found in cerebrospinal fluid. Journal of clinical microbiology. 1994 Feb 1;32(2):335-51. DOI: https://doi.org/10.1128/jcm.32.2.335-351.1994
doi: 10.1128/jcm.32.2.335-351.1994
Lu JJ, Perng CL, Lee SY, Wan CC. Use of PCR with universal primers and restriction endonuclease digestions for detection and identification of common bacterial pathogens in cerebrospinal fluid. Journal of clinical microbiology. 2000 Jun 1;38(6):2076-80.
doi: 10.1128/.38.6.2076-2080.2000 DOI: https://doi.org/10.1128/.38.6.2076-2080.2000
Rådström P, Bäckman A, Qian NY, Kragsbjerg P, Påhlson C, Olcén P. Detection of bacterial DNA in cerebrospinal fluid by an assay for simultaneous detection of Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, and streptococci using a seminested PCR strategy. Journal of Clinical Microbiology. 1994 Nov 1;32(11):2738-44.
doi: 10.1128/jcm.32.11.2738-2744.1994 DOI: https://doi.org/10.1128/jcm.32.11.2738-2744.1994
Saravolatz LD, Manzor O, VanderVelde N, Pawlak J, Belian B. Broad-range bacterial polymerase chain reaction for early detection of bacterial meningitis. Clinical infectious diseases. 2003 Jan 1;36(1):40-5.
doi: 10.1086/345438 DOI: https://doi.org/10.1086/345438
Xu J, Millar BC, Moore JE, Murphy K, Webb H, Fox AJ, Cafferkey M, Crowe MJ. Employment of broad-range 16S rRNA PCR to detect aetiological agents of infection from clinical specimens in patients with acute meningitis–rapid separation of 16S rRNA PCR amplicons without the need for cloning. Journal of applied microbiology. 2003 Feb;94(2):197-206.
doi: 10.1046/j.1365-2672.2003.01839.x DOI: https://doi.org/10.1046/j.1365-2672.2003.01839.x
Schuurman T, De Boer RF, Kooistra-Smid AM, Van Zwet AA. Prospective study of use of PCR amplification and sequencing of 16S ribosomal DNA from cerebrospinal fluid for diagnosis of bacterial meningitis in a clinical setting. Journal of clinical microbiology. 2004 Feb 1;42(2):734-40.
doi: 10.1128/jcm.42.2.734-740.2004 DOI: https://doi.org/10.1128/JCM.42.2.734-740.2004
Deutch S, Pedersen LN, Pødenphant L, Olesen R, Schmidt MB, Møller JK, Ostergaard L. Broad-range real time PCR and DNA sequencing for the diagnosis of bacterial meningitis. Scandinavian journal of infectious diseases. 2006 Jan 1;38(1):27-35.
doi: 10.1080/00365540500372861 DOI: https://doi.org/10.1080/00365540500372861
Chakrabarti P, Das BK, Kapil A. Application of 16S rDNA based seminested PCR for diagnosis of acute bacterial meningitis. Indian Journal of Medical Research. 2009 Feb 1;129(2):182-8.
Bergh K, Stoelhaug A, Loeseth K, Bevanger L. Detection of group B streptococci (GBS) in vaginal swabs using real-time PCR with TaqMan probe hybridization. Indian Journal of Medical Research. 2004 May 1;119:221-3.
Bonab ZH, Farajnia S, Ghotaslou R, Nikkhah E. Evaluation of nested PCR method for diagnosis of meningitis due to Neisseria meningitidis and Haemophilus influenzae. Turkish Journal of Biology. 2012 Nov 21;36(6):727-31. DOI: https://doi.org/10.3906/biy-1111-27
Nigrovic LE, Malley R, Macias CG, Kanegaye JT, Moro-Sutherland DM, Schremmer RD, Schwab SH, Agrawal D, Mansour KM, Bennett JE, Katsogridakis YL. Effect of antibiotic pretreatment on cerebrospinal fluid profiles of children with bacterial meningitis. Pediatrics. 2008 Oct 1;122(4):726-30. DOI: https://doi.org/10.1542/peds.2007-3275
Nour M, Alaidarous A. Simultaneous Detection of Bacterial Meningitis in Suspected Cases of Meningitis in Children Using PCR Assay. Arch Clin Microbiol. 2017; 8:1-6.
Henry M Wu, Soraia M Cordeiro, Brian H Harcourt. BMC Infectious Diseases. 2013, 13:26.
Camacho-Gonzalez A, Spearman PW, Stoll BJ. Neonatal infectious diseases: evaluation of neonatal sepsis. Pediatric Clinics of North America. 2013 Apr;60(2):367–89.
doi: 10.1016/j.pcl.2012.12.003 DOI: https://doi.org/10.1016/j.pcl.2012.12.003
Chang CJ, Chang WN, Huang LT, Huang SC, Chang YC, Hung PL, Lu CH, Chang CS, Cheng BC, Lee PY, Wang KW. Bacterial meningitis in infants: the epidemiology, clinical features, and prognostic factors. Brain and development. 2004 Apr 1;26(3): 168-75.
doi: 10.1016/s0387-7604(03)00122-0 DOI: https://doi.org/10.1016/S0387-7604(03)00122-0
Manoharan A, Manchanda V, Balasubramanian S, Lalwani S, Modak M, Bai S, Vijayan A, Shet A, Nagaraj S, Karande S, Nataraj G. Invasive pneumococcal disease in children aged younger than 5 years in India: a surveillance study. The Lancet Infectious Diseases. 2017 Mar 1;17(3):305-12.
doi: 10.1016/s1473-3099(16)30466-2 DOI: https://doi.org/10.1016/S1473-3099(16)30466-2
Jayaraman Y, Veeraraghavan B, Chethrapilly PGK. Burden of bacterial meningitis in India: Preliminary data from a hospital-based sentinel surveillance network. PLoS ONE. 2018; 13(5): e0197198.
doi: 10.1371/journal.pone.0197198 DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0197198
Invasive Bacterial Infection Surveillance (IBIS) group, International Clinical Epidemiology Network (INCLEN). Prospective multicentre hospital surveillance of Streptococcus pneumoniae disease in India. Lancet. 1999; 353: 1216-21.
doi: 10.1016/s0140-6736(98)07228-6 DOI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(98)07228-6
Sachdeva A, Kukreja S, Jain V, Dutta AK. Meningococcal disease-outbreak in Delhi. Indian Pediatrics. 2005 Jun 17;42(6):547-56.
##submission.downloads##
Опубліковано
Як цитувати
Номер
Розділ
Ліцензія
Автори, які надіслали свій рукопис до Міжнародного журналу медицини та медичних досліджень, погоджуються з такими умовами:
1. Автори зберігають авторські права та надають журналу право на першу публікацію з одночасною ліцензією Creative Commons Attribution License CC-BY-NC, яка дозволяє іншим ділитися роботою з визнанням авторства роботи та початкової публікації в цьому журналі.
2. Автори, здатні укладати окремі додаткові договірні угоди щодо неексклюзивного розповсюдження опублікованої журналом версії роботи (наприклад, опублікувати її в інституційному сховищі чи опублікувати в книзі) з підтвердженням її початкової публікації в цьому журналі.
3. Авторам дозволяється та заохочується публікувати свою роботу в Інтернеті (наприклад, в інституційних репозитаріях або на веб-сайті) до та під час процесу подання, оскільки це може призвести до продуктивного обміну, а також до більш раннього та більшого цитування опублікованої роботи ( Див. Вплив відкритого доступу ).
