ІНТЕГРОВАНЕ СЕРЕДОВИЩЕ АВТОМАТИЗАЦІЇ РОБОТИ З ВЕЛИКИМИ ОБ’ЄМАМИ ДАНИХ В ГРІД
DOI:
https://doi.org/10.11603/mie.1996-1960.2009.3.83Анотація
Проаналізовано існуючі проблеми взаємодії програмного забезпечення та дослідників з Грід-середовищем. Запропоновано методики створення інтегрованого середовища автоматизації роботи з великими об'ємами даних в Грід. Методики реалізовано для автоматизації задач розрахунку молекулярної динаміки біологічних макромолекул. Інтегроване середовище впроваджено в віртуальній лабораторії MolDynGrid для автоматизації розрахунків для вирішення задач комп'ютерної структурної біології.
Посилання
Foster I., Kesselman C. The Grid: Blueprint for a New Computing Infrastructure. Second Edition. Elsevier, 2003 .
Foster I. The Anatomy of the Grid: Enabling Scalable Virtual Organizations/ Foster I., Kesselman C., Tuecke S. // International Journal of High Performance Computing Applications. - 2001. 15, №> 3. - P. 200-222. DOI: https://doi.org/10.1177/109434200101500302
Загородній А. Г. Грід - нова інформаційно-обчислювальна технологія для науки / Загородній А. Г., Зіновьев Г. М., Мартинов Є. С., Свистунов С. Я., Шадура В. Н. // Вісник НАН України. - 2005. - № 6. - C. 17-25.
Корнелюк О.І. Сучасні комп'ютерні Грід-технології та їх застосування в медичних дослідженнях / Корнелюк О.І., Мінцер О.П. // Медична інформатика та інженерія. - 2008.- Т. 1, № 1. - C. 23-29.
Oliveira I.C. A Grid requirements for the integration of biomedical information resources for health applications / Oliveira I.C.,Oliveira J.L.,Sanchez J.P.jLj'pez-Alonso VMartin-Sanchez F.,Maojo V,Sousa Pereira A//Methods Inf. Med.-2005. - Vol. 44, J№ 2. - P. 161-167. DOI: https://doi.org/10.1055/s-0038-1633938
Breton V Innovative in silico approaches to address avian flu using grid technology / Breton V, da Costa A.L., de Vlieger P., Kim Y.M., Maigne L., Reuillon R., Sarramia D., Truong N.H., Nguyen H.Q., Kim D., Wu Y.T. // Infect. Disord. Drug Targets. - 2009. - Vol. 9, №> 3. - P. 358-365. DOI: https://doi.org/10.2174/1871526510909030358
Konagaya A. Trends in life science grid: from computing grid to knowledge grid / Konagaya A. // BMC Bioinformatics. - 2006. - Vol. 18, J№ 7, Suppl 5. - P. 10. DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-S5-S10
Rom6n I. Improving healthcare middleware standards with semantic methods and technologies / Rom6n I., Calvillo J.,
Roa L.M., Madinabeitia G. // Stud, Health Technol. Inform.-2008. - Vol. 137. - P. 181-189.
Tai K. BioSimGrid: towards a worldwide repository for biomolecular simulations / Tai K., Murdock S., Wu B., Ng M.H., Johnston S., Fangohr H., Cox S.J., Jeffreys P., Essex J.W., Sansom M.S. // Org. Biomol. Chem. - 2004. - Vol. 2, №> 22. - P. 3219-3221. DOI: https://doi.org/10.1039/b411352g
Salnikov A.O. Implementing the File Storage System in the Ukrainian Academic Grid Infrastructure / Salnikov A.O., Sliusar I.A., Sudakov O.O., Boyko YuV, Kornelyuk O.I. // Abstracts of 21th International CODATA Conference "Scientific Information for Society-from Today to the Future". - 2008. - P. 31.
Salnikov A.O. MolDynGrid Virtual Laboratory as a part of Ukrainian Academic Grid infrastructure / Salnikov A.O. , Sliusar I.A., Sudakov O.O., Savytskyi O.V., Kornelyuk O.I. // Proceedings of IEEE International Workshop on Intelligent Data Acquisition and Advanced Computing Systems: Technology and Applications. - 2009. - P. 59-63. DOI: https://doi.org/10.1109/IDAACS.2009.5342989
Kim B.G. Drug Screener-G: Towards an Integrated Environment for Grid-Enabled Large-Scale Virtual Screening and Drug Discovery / Kim B.G., Nhan N.D., Lee S., Hwang S., Breton B. // Fourth IEEE International Conference on eScience. - 2008. - P. 666-671. DOI: https://doi.org/10.1109/eScience.2008.26
Jin H. Components and workflow based Grid programming environment for integrated image-processing applications / Jin H., Zheng R., Zhang Q., Li Y. // Concurrency and Computation: Practice and Experience. - 2006. - Vol. 18, N° 14. -P 1857-1869. DOI: https://doi.org/10.1002/cpe.1034
Завантаження
Опубліковано
Номер
Розділ
Ліцензія
Журнал Медична інформатика та інженерія дозволяє автору (ам) зберігати авторські права без реєстрації.
Журнали Медична інформатика та інженерія відкритого доступу публікує відкриті статті відповідно до умов Creative Commons Attribution (CC BY) Ліцензії, яка дозволяє використання, поширення та відтворення на будь-якому носії, за умови, що оригінальний твір правильно цитується.
Цей журнал доступний через Creative Commons (CC) License CC-BY 4.0
